情報が古いみたいですね。
現在、タケキャブという制酸剤を使用した１次除菌は95%程度成功します。また2次除菌は90%台後半の確率で成功しますので、1次除菌と2次除菌を共に失敗する確率は0.1%くらいです。
今からあまり心配しなくていいのでは？
ちなみに、通常4次除菌くらいは普通にやられています。