非常に慎重にされるなら、1次除菌がダメだった時に2次除菌を行うことを考えて、除菌成功まで待つというのも手です。
ただ、1次除菌成功率は95％ですので先に妊活を始めて、もし除菌失敗だった場合はその時点で妊娠していれば出産し授乳を終えた後に2次除菌を行うというのも手です。