除菌について

昨日から除菌を始め2日目の夜になりました。
特に副作用は出てないのですが
夕飯後に胃が気持ち悪くて少し吐いてしまいました。
前から、調子が悪いと吐いてしまう事がたまにあるので
体は大丈夫だと思うのですが、
吐いてしまった事で除菌に何か影響してしまいますか？
薬を飲む前だったので、その後お茶を飲んでから薬を飲みました。