胃・十二指腸潰瘍（瘢痕を含む）が、バリウム検査（おそらく質問者様がおっしゃっているX線検査とはこのことかと思いますが）あるいは胃カメラで確認された場合は保険適応で除菌できます。検査からあまり時間が経つと保険が適応されないこともありますのでお早めに医療機関にお問い合わせください。
保険が適応されない場合の金額は医療機関によって違いますが、通常１万円から２万円台です。